TogoID による生命科学データベースの横断利用 @ データ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」

https://doi.org/10.7875/togotv.2025.042 -- 本日の統合TVは、2025年6月26日に開催された データ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」から、ライフサイエンス統合データベースセンター 池田 秀也 による「TogoID による生命科学データベースの横断利用」(講習スライド https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2025-06-26-04-Ikeda.pdf 、Q&A https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2026-06-26-KG-and-Ontology-QA.pdf )をお送りします。 TogoID (https://togoid.dbcls.jp/)は遺伝子、タンパク 質、化合物、文献など異なるデータベースで使われる ID を相互に変換・連携できる公開サービスです。本講義では、ウェブブラウザ上で ID 間の対応関係を取得する基本操作から、遺伝子シンボルなどのラベルを ID に変換する機能、RESTAPI による自動化、オントロジーとの併用で得られる統合解析の例まで、実践的な横断利用の手法を紹介します。 00:37 概要 02:21 生命科学データベース利用におけるID変換の必要性 04:43 TogoIDについて 15:28 対象データベース 16:59 様々な利用例 23:15 REST API 24:05 TogoID Ontology 25:24 TogoID RDF版をRDF Portalで提供 28:00 IDペア取得プログラムの開発と公開 29:16 ID変換において注意するべき点 31:03 まとめ　　 -- #togotv#DBCLS#bioinformatics