Rを用いた空間解析の基礎と空間データベースの紹介 @ データ解析講習会：AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」

https://doi.org/10.7875/togotv.2026.004 本日の統合TVは、2025年12月18日に開催された データ解析講習会：AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」(https://biosciencedbc.jp/event/ajacs/ajacs2025-12-18-spatial-transcriptmics.html)から、k京都大学 VANDENBON Alexis氏 による「Rを用いた空間解析の基礎と空間データベースの紹介」(講習スライド https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2025-12-18-03-spatial-transcriptmics-vandenbon.pdf、Q&A https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2025-12-18-spatial-transcriptmics-QA.pdf)をお送りします。 まず、R を用いた空間トランスクリプトミクス解析の基礎から応用までを紹介します。空間遺伝子発現データの可視化・クラスタリング・空間的パターン解析など、代表的な R パッケージを用いた解析手法を解説します。また、空間トランスクリプトミクス関連データベースの概要を紹介し、最後に講師が開発した空間データベース DeepSpaceDB の機能と活用例を示します。本講義を通じて、参加者は空間トランスクリプトミクス解析の基本的な流れを理解し、主要な R ツール用いたデータ解析 や公開データベースの活用方法を身につけることを目指します。 ※ 講義資料は日本語で作成し、講義は英語で実施します。 -- #togotv#DBCLS#bioinformatics