解析事例（腫瘍微小環境/SKNY）@ データ解析講習会：AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」

https://doi.org/10.7875/togotv.2026.005 本日の統合TVは、2025年12月18日に開催された データ解析講習会：AJACS「空間トランスクリプトーム解析を知って・学んで・使う」(https://biosciencedbc.jp/event/ajacs/ajacs2025-12-18-spatial-transcriptmics.html)から、k東京大学 酒井 俊輔氏 による「解析事例（腫瘍微小環境/SKNY）」(講習スライド https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2025-12-18-04-spatial-transcriptmics-sakai.pdf、Q&A https://biosciencedbc.jp/event/files/AJACS-2025-12-18-spatial-transcriptmics-QA.pdf)をお送りします。 空間オミクス解析/シングルセル解析に関連する複数のライブラリ (scanpy、stlearn、squidpy) を組み合わせた解析事例を紹介します。また、がん胞巣や血管性ニッチェなどの局所的な微小環境解析に特化したアルゴリズムSpatialKNifeY (SKNY) を紹介します。 -- #togotv#DBCLS#bioinformatics