GRNに基づくin silico perturbationツールCellOracleの紹介

https://doi.org/10.7875/togotv.2025. 2025年12月17日に開催された、Bio"Pack"athon2025#12の神元健児氏による「GRNに基づくin silico perturbationツールCellOracleの紹介」をお送りします。本講演では、scRNA-SeqとscATAC-Seqデータを入力とし、遺伝子制御ネットワーク（GRN）を推定し、GRN上の特定の転写因子をin silicoにノックアウトさせた時の発現変化を予測するツールであるCellOracleについて紹介しています。 この講演動画は、Bio"Pack"athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。 Bio"Pack"athonでは、以下のような活動をしています。 ・パッケージ開発に関するミートアップ（月一開催） ・日本語によるパッケージング教材の拡充化 ・Bioconductorへの登録サポート パッケージングに興味がある方、パッケージ化したいデータベースや解析手法がある方は、ぜひお気軽にご参加ください。Twitterアカウント@biopackathonにて最新情報を発信しています。 -- 使用音楽クレジット [BGM] "May not" Music by Khaim : https://www.khaimmusic.com/ "From Here on In" Music by　Everet Almond from Youtube オーディオライブラリ [Ending] "Geneve" Music by Khaim : https://www.khaimmusic.com/ -- #togotv#DBCLS#bioinformatics